由于肛窦的两旁就是肛乳头，所以肛窦发炎后首先是波及肛乳头，引起肛乳头发炎，肿胀肥大。
肛窦和肛乳头的充血水肿我们分别叫肛窦炎和肛乳头炎，那么什么是肛窦和肛乳头呢？直肠从中部往下端逐渐变细缩窄，随着肠腔在肛门处的收缩，肠壁的粘膜就像人衣服的袖口一样折叠起来，形成许多纵长隆起的皱襞，医学上叫直肠柱或肛柱。两个柱底之间靠一个半月形皱襞相连，这个半月形皱襞叫肛门瓣。两个直肠柱与肛门瓣之间形成了一个漏斗状开口向上的凹陷小窝，这个小窝就是肛窦，又叫肛隐窝。在直肠柱与肛管相连的齿状线上，直肠柱末端的粘膜与肛管皮肤形成了数个圆锥状突起，呈黄白色的小乳头，就是肛乳头。
肛窦底部有能够分泌液体的肛门腺和肛门腺导管，平时能分泌出粘性液体，润滑大便和保护直肠肛门。由于肛窦像一个漏斗，开口向上张着，粪便和其他脏东西，就很容易积存在窦里，同时也容易被硬的粪便擦伤弄破。细菌侵入之后就会引起肛窦内感染，并沿着肛门腺导管和肛门腺蔓延，所以肛窦炎又是引起多种肛门直肠病的根源，如肛门直肠周围脓肿、肛瘘、肛裂、痔疮、肛乳头炎等，肛管上皮癌的发生，也与慢性肛窦炎症的刺激有关。
由于肛窦的两旁就是肛乳头，所以肛窦发炎后首先是波及肛乳头，引起肛乳头发炎，肿胀肥大。临床上肛窦炎和肛乳头炎常常是伴在一起发生的。
肛窦炎和肛乳头炎的表现不明显，常会被患者忽视，不及时去就医。
肛窦炎主要表现为肛门内间歇疼痛，急性发炎时肛门内有刺痛、灼热感、下坠感、排便时疼痛加重，常有少量粘液或鲜血排出，便后可引起肛门括约肌痉挛，持续疼痛数小时。慢性缓解期，病人无明显症状，仅在排便后，感到肛门内有短暂的微痛或不适，偶尔有肛门内向会阴、尾骶部放射的疼痛。
肛乳头炎主要表现为平时感到肛门内有异物感，随着乳头增生肥大，排便时乳头可脱出肛门外。小的乳头便后可自行回到肛门内，大的需用手推回肛门内。如不及时复位，可引起肛门水肿、胀痛。肿大乳头被刺激或破溃后，可使肛腺分泌增加，引起肛门部潮湿发痒。
肛乳头炎主要表现为平时感到肛门内有异物感，随着乳头增生肥大，排便时乳头可脱出肛门外。小的乳头便后可自行回到肛门内，大的需用手推回肛门内。如不及时复位，可引起肛门水肿、胀痛。肿大乳头被刺激或破溃后，可使肛腺分泌增加，引起肛门部潮湿发痒。
初起可以采取保守疗法。祖国医学认为此病多以湿热下注，大肠热毒多见。临床辨证施治，一般多用五味消毒饮和黄连解毒汤化裁，成药可以选用牛黄解毒片、连翘败毒丸、二妙丸等。或服用先锋霉素、磺胺类药物控制感染。外用安氏熏洗剂坐浴熏洗，肛门内可用痔疮栓、京万红等消炎。
药物治疗无效，局部炎症不减轻，反复发作者，可考虑手术治疗。肛乳头切除术：小的肛乳头可直接切除，乳头大的则需要用线结扎基底部后切除。